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  1. 能否简单易懂的介绍外显子(exon),内含 …

    外显子 (Exon): DNA链或前体mRNA上能够编码蛋白质的核苷酸片段 [1] 由DNA转录后先形成前体mRNA (pre-mRNA),这些未成熟的mRNA需要经过一定的加工,如剪接,去除内含子5'端加一 …

  2. 一个UTR可能来自于多个exon是什么意思? - 知乎

    Mar 14, 2023 · 一个UTR可能来自于多个exon意味着UTR区域不是由单个exon构成的,而是由多个exon拼接而成的。 在基因组DNA序列中,UTR区域通常是由多个不连续的exon序列组成,这 …

  3. m6A的修饰作用是什么? - 知乎

    Jun 20, 2022 · mRNA和ncRNA中m6A的功能 [1] 以往研究中,m6A效应蛋白根据其活动主要分为三类,催化m6A甲基化的 “writers”,优先结合m6A的“readers”,以及逆转m6A甲基化的 …

  4. 一文了解Count、FPKM、RPKM、TPM | 相互间的转化 | 收藏教程

    Jan 21, 2022 · sRNA_seq等测序长度较短的高通量测序经常采用RPM进行标准化,因为sRNA长度差异较小,18-35 nt较多,所以长度对不同的small RNAs相互比较影响较小 (优点:计算简单 …

  5. 如何读懂基因组gff3注释文件? - 知乎

    知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业 …

  6. 为什么说FPKM和RPKM都错了? - 知乎

    2、FPKM: 全称为Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments,FPKM与RPKM的原理类似,区别在于FPKM是Fragments,而RPKM则是reads。 …

  7. 转录时时遇到终止子还是终止密码子才停止? - 知乎

    转录(Transcription)指的是从DNA模版转变为Pre-mRNA的过程,自起动子(Promoter)开始,遇到终止子(Terminator)停止。此处的终止子并不是一个简单的DNA序列,而是一段长达 …

  8. 怎样用初学者能看懂的语言介绍,如何设计引物? - 知乎

    1、设计引物 2、验证引物好坏 3、外显子内含子(Exon/intron) 如果设计的引物是跨内含子和外显子的交界处,可在此处设置成为Primer must span an exon-exon junction。 外显子的匹配碱 …

  9. 转录组分析中,怎么将readcount转化为fpkm? - 知乎

    1.FPKM= read counts / (mapped reads (Millions) * exon length (KB)) mapped reads这个参数而言,大多数人还是定义为有效的reads,即mapped reads。 用你的bam文件和picard 可以算 2. …

  10. KRAS基因第二外显子发生突变是什么意思?如何治疗? - 知乎

    KRAS全称是鼠肉瘤病毒癌基因,第二号外显子突变有很多类型,比如G12C、G12D、G12V等等,对于这类基因突变的治疗要分部位的。首先对于肺部,KRAS.G12C基因突变可以选 …